El Barcelona Sporting Club fue fundado el 1 de mayo de 1925 por un grupo de jóvenes aficionados al fútbol en el barrio del Astillero en la ciudad de Guayaquil. 31 personas se convierten en los primeros socios nombres como los de Don Eutimio Pérez Arumí, Victoreano Arteaga, Pablo Pelaéz, Valentín Sala, Juan Domenech, Gago Peré, entre otros donde estaban los muchachos ecuatorianos de La Gallada de los Modelo, se dieron cita en la casa del Catalán Don Eutimio Pérez Arumí (nació en Vilassar de Mar, Barcelona-España).

Ubicada en la intersección de las calles Concordia e Independencia (actualmente, Eloy Alfaro y Francisco de Marcos). El grupo de jóvenes, conocidos como "La Gallada de la Modelo", eligió al ecuatoriano Don Carlos García como el primer presidente de la joven institución, y también se designó al español Onofre Castells como presidente honorario. El primer sindico de Barcelona Sporting Club fue el Dr. José Miguel García Moreno, Guayaquileño.

El Barcelona Sporting Club fue fundado el 1 de mayo de 1925 por un grupo de pillos aficionados al fútbol en el barrio del Astillero en la ciudad de Guayaquil. 31 personas se convierten en los primeros socios. Nombres como los de Don Eutimio Pérez I Arumí, Victoreano Arteaga, Pablo Pelaéz, Valentín Sala, Juan Domenech, Alberto March Obiols, Gago Peré, entre otros, donde estaban los muchachos de La Gallada de Los Modelo, los cuales se dieron cita en la casa del catalán Don Eutimio Pérez I Arumí, ubicada en la intersección de las calles Concordia e Independencia (actualmente Eloy Alfaro y Francisco de Marcos). Aquel grupo de jóvenes eligió al ecuatoriano Carlos García como el primer presidente de la joven institución, y también se designó al español Onofre Castells como presidente honorario. El primer sindico de Barcelona Sporting Club fue José Miguel García Moreno, abogado Guayaquileño.

El nombre de la institución hace referencia a la ciudad de Barcelona, y se le fue puesto este nombre en agradecimiento al apoyo brindado por la comunidad española a la ciudad de Guayaquil. Además, varios de los socios fundadores eran originarios de aquella ciudad. Camiseta negra, cuello y pantaloneta blanca fueron sus primeros colores, pero como en la Federación ya existía un equipo con similar uniforme el señor Alberto March Obiols trajo desde España los uniformes con los colores de la Madre Patria oro y grana.

El 1 de junio de 1925 se realizó la afiliación del equipo a la Federación Deportiva del Guayas. Para la cual los cerca de 240 socios aportaron con 50 centavos por cada uno para poder registrar al club. Días después, el 15 de junio, el Barcelona tuvo su primer partido de manera oficial frente al C.S. Ayacucho el cual lo derrotó con un marcador de 1-0. Este partido marcaría el comienzo de la institución en el fútbol nacional con su primera plantilla conformada por Rigoberto Aguirre como guardameta; Carlos Sangster, Joaquín Franco, Bolívar Guzmán y Manuel Murillo Moya en la zaga; mientras que Otón Márquez de la Plata, Gonzalo Zevallos, José Moría se mantenían de mediocampistas; finalmente Joaquín Pacheco, Julio Criollo y Rafael Viteri conformaban la línea de delanteros. El invierno de 1925 fue muy fuerte y se prolongó hasta junio, ello obligó a postergar el Campeonato Amateur del Guayas. Esto benefició al equipo debutante cuya inscripción fue aceptada y se lo ubicó en la Serie B del Fútbol Federativo. Viene la recordada Revolución Juliana y el Golpe Militar retrasa el inicio de torneo, el comienzo del mismo se da el 2 de agosto pero Barcelona juega el 9.

Este equipo inicialmente jugó en la Serie B de la FedeGuayas y ese mismo año ganó su derecho de participar en 1926 en la Serie A. En el primer torneo en la Serie A, Barcelona terminó en séptimo lugar y lo rescatable fue el triunfo 3-2 sobre el campeón reinante Racing Club. La tarde del 9 de agosto a las 3:30 en el Estadio Municipal (Actual Ramón Unamuno), Barcelona jugaría su primer partido oficial de fútbol frente al Club Sport Ayacucho, el cuadro torero alineó de la siguiente manera, con León Franco en el arco, Carlos Sangster, Joaquín Franco, Bolívar Guzmán y Manuel Murillo Moya en la defensa, Otón Márquez de la Plata, Gonzalo Zevallos y José Morla en el mediocampo y Joaquín Pacheco, Julio Criollo y Rafael Viteri como delanteros. Con un penal muy discutible que sancionó el árbitro Julio Roditti, gana Ayacucho 1-0, pero Barcelona deja en la cancha una buena impresión, mereciendo elogios de la revista “La Semana Deportiva”.

Durante los años 1940, la popularidad del Barcelona creció, en parte gracias a los encuentros disputados con los equipos colombianos de Asociación Deportivo Cali y Club Deportivo Los Millonarios, dos de los mejores equipos de la era futbolística de Colombia conocida como El Dorado, obteniendo resultados favorables para el "equipo torero". El Millonarios era considerado en esa época como el mejor equipo de Colombia y contaba con jugadores de gran reputación como Alfredo Di Stéfano, Néstor Raúl Rossi y Adolfo Pedernera. Durante los partidos disputados en la ciudad de Guayaquil, el Barcelona derrotó al Millonarios en dos ocasiones con resultados de 3-2 el 31 de agosto de 1949 y 1-0 el 21 de mayo de 1952. A esta hazaña se la conoce como La Victoria a Millonarios¹⁹ El 23 de agosto se da la primera victoria; en la alineación se registra una novedad, la aparición de Rigoberto Aguirre en el arco conocido como “Pan de Dulce”, puesto que ocuparía por muchos años, imprimiendo una originalidad al momento de atajar: lo hacía “cabeceando”. Barcelona vence 3-1 a Club Sport Libertad, resultados que sorprendió a muchos, la campaña continuó con triunfos sobre Auto RePair, una derrota en la revancha con Libertad y un polémico empate con Ayacucho. La temporada termina con Ayacucho en el Primer lugar, Barcelona igualado con Libertad en el segundo Puesto. Como debían subir dos equipos, se disputa el 13 de diciembre un partido extra que lo gana Barcelona 3 a 1, con goles de Galo Pombar, Otón Idrovo y Pedro Pablo Peláez. Posteriormente la Federación también ascendió a Libertad, pero el Barcelona le quedo la satisfacción de haber ganado el ascenso en la cancha en su Primer año de vida .

El primer campeonato nacional de 1957 estaba conformado por la presencia de los dos mejores equipos de cada ciudad. Los equipos guayaquileños eran el Barcelona y el Emelec, mientras que los equipos quiteños eran el Deportivo Quito y el Aucas. Tras los partidos disputados en el torneo, el Emelec se proclamaría campeón, mientras que Barcelona solo obtendría con el vicecampeonato.

En 1960 se realizó nuevamente el campeonato nacional en el mismo formato de 1957, en el cual estarían cuatro equipos de cada asociación. Al final el Barcelona se proclamaría campeón nacional por primera vez.

Después de obtener su primer título, clasificó para la Copa Libertadores de América en 1961, convirtiendo en el primer equipo ecuatoriano en competir en este torneo. Ese año el campeonato nacional lo ganaría el Emelec, quedando como subcampeón el Club Sport Patria. Para 1962, el cuadro amarillo no encajaría en una buena posisión en el campeonato, mientras que el Club Deportivo Everest se coronaría campeón nacional. Al año siguiente, en 1963 ganó su segundo título como campeón nacional, dejando en segundo lugar al Emelec. Desde entonces la rivalidad de ambos equipos sería más notoria. En 1964 y en 1965 los campeones serían el Emelec y el Deportivo Quito respectivamente, mientras que el siguiente año, 1966, el Barcelona, en un partido frente al Aucas obteniendo un empate se coronó por tercera vez como campeón nacional.

Por esos años el presidente de Barcelona era un joven de 25 años llamado Galo Roggerio. El llegaba con una grandísima responsabilidad para alguien tan joven. Éste contrató al entrenador Otto Vieira, un estratega brasilero que venía de dirigir a clubes de fama como el: Atlante de México, Oporto de Portugal, Millonarios de Colombia, entre otros.

La duodécima edición del torneo de la Copa Libertadores de América tenía la participación del campeón de 1970 Barcelona y el subcampeón Emelec en el grupo 5, Barcelona ganó la llave por encima de Emelec y de los cuadros colombianos Deportivo Cali y Junior.

En la Segunda Fase, Barcelona estuvo en el grupo 2 junto con Unión Española de Chile y Estudiantes de Argentina. Barcelona empezó perdiendo en Guayaquil frente a Estudiantes el 18 de abril, luego el 25 consigue su primera victoria por la mínima diferencia ante Unión Española también en Guayaquil y el destino le tenía preparado algo bueno para Barcelona.

El 29 de abril se enfrentaron Estudiantes de la Plata y Barcelona, en La Plata. Estudiantes venía siendo Triple Campeón de América (1968, 1969 y 1970) y del Mundo. El partido era muy parejo y hasta que en una jugada de Alberto Spencer quien habilita a Juan Manuel Bazurco y este se anticipa la salida del "Bambi" Flores y marca el gol que le quitó el invicto a Estudiantes en su propio estadio a esta victoria se la conoce como "La Hazaña de la Plata".

En 1971 Barcelona alcanzó el primer bicampeonato de la historia del fútbol nacional. Con una plantilla de lujo en las que destacaban los uruguayos Jorge Phoyú y Luis Alberto Alayón, Alfonso Quijano, Víctor Peláez, Jorge Bolaños, Nelsinho, Alberto Spencer, Washington Muñoz. Por su constelación de estrellas y la inversión económica de 240.000 sucres se prevenía una arrolladora primera etapa, esto no se dio pero se clasificó a la siguiente etapa. Su director técnico Otto Vieira confiaba que el equipo entraría en buen ritmo y empezaría a ser protagonista del torneo. Otro de los problemas que tuvo que enfrentar el elenco "torero" fueron las lesiones y enfermedades de los jugadores que modificaron el once abridor, así Barcelona se ubicó dentro de los 8 primeros equipos, ubicándose en sexto lugar con 17 puntos.

De pronto aprareció la magia de Alberto Spencer, más el gran toque en la media cancha de "Perico" León, ex seleccionado peruano, acompañado del mágico mediocampista Jorge Bolaños. Otro de los jugadores destacados fue José Paes, quien fue uno de los hombres claves en el planteamiento de Vieira con un 4-4-2, así con un equipo fluido, dúctil, sacando a relucir las virtudes de Gerson, Miguel Ángel Coronel, Juan Noriega y los goles del sacerdote español Juan Manuel Bazurco.

Jugando en el Olímpico Atahualpa, Barcelona se enfrentó a Liga de Quito en un partido difícil, de mucho suspenso hasta el final. Nelsinho y Gerson marcaron los goles para el cuadro amarillo y un penal atajado por Alayón dieron un triunfo para el cuadro del Astillero y el primer bicampeonato lo ponía Barcelona, el partido terminó 2-1 victoria torera.

Después de esos dos exitosos años en la vida institucional del Barcelona, el club cayó en un período de mala racha que duró por los siguientes nueve años. Durante este período no ganó ningún título nacional ni clasificó a la Copa Libertadores hasta el comienzo de la siguiente década.

En los años 1980, el Ídolo, como popularmente es llamado, obtendría buenos resultados que comenzaron en 1980 y 1981 cuando ganó por sexta y séptima vez el campeonato ecuatoriano, ganando por segunda vez un "bicampeonato" y dejando atrás el período de malas rachas. En 1982 no alcanzó el título quedando como subcampeón, pero después de tres años en 1985 obtuvo su octavo campeonato, al año siguiente (1986) fue subcampeón nuevamente, luego retomó el campeonato en 1987.

Además de quedar campeón, bajo la presidencia de Isidro Romero, en 1987 Barcelona inauguraría su estadio propio, ya que el equipo solía jugar en el Estadio Modelo. Con una capacidad máxima de 90 000 personas, el estadio es considerado como uno de los más grandes del mundo. La inauguración se celebró con un torneo cuadrangular Copa Ciudad de Guayaquil, en el cual el partido de apertura fue disputado entre el Barcelona Sporting Club contra el Fútbol Club Barcelona de España, con victoria del equipo ecuatoriano de 2-1. El torneo lo ganaría al final el Emelec. Para finalizar la década de los 80, el Barcelona obtendría en 1989 su décimo título nacional, con lo cual ganó una clasificación a la Copa Libertadores del siguiente año.

1997 - 13º Título

En la Copa Libertadores 1990 el Barcelona comenzó en el Grupo A, en donde tuvo que clasificar con desempate. Ya en los octavos de final derrotó al Club Atlético Progreso de Uruguay, mientras que en los cuartos de finales se enfrentó al Emelec al cual también derrotó. En semifinales el Barcelona tuvo que enfrentar al River Plate de Argentina, obteniendo la victoria mediante una tanda de penales, con lo cual clasificó a la final. La final de la Copa Libertadores de 1990 fue disputada entre el Barcelona y el Club Olimpia de Paraguay. El partido de ida fue en la ciudad de Asunción el 3 de octubre, con la asistencia de Juan Daniel Cardelino (ARG) como árbitro, donde el equipo local derrotó al Barcelona por 2-0. En el partido de vuelta, disputado en la ciudad de Guayaquil en el Estadio Monumental Isidro Romero Carbo el 10 de octubre, con la presencia de Juan Carlos Loustou(URU) como arbitro central, el Barcelona no pudo dar vuelta al resultado empatando a 1 con el equipo paraguayo. El Olimpia se convirtió en el campeón de la edición de 1990 de la Copa Libertadores de América, mientras que el subcampeón, Barcelona, se convirtió en el primer equipo ecuatoriano en jugar una final de este torneo internacional. A comienzo de los años 1990, Barcelona incrementaría sus títulos, tal cual es el caso del décimo primer título nacional alcanzado en 1991, y luego por dos años consecutivos quedó subcampeón. En el año de 1995 ganó su décimo segundo campeonato ecuatoriano, hecho que volvió a ocurrir en el año de 1997, con lo cual clasificó a la Copa Libertadores de 1998.

Para la Copa Libertadores 1998 el Barcelona llegaría nuevamente a la final del torneo, derrotando en su trayecto a equipos como Cerro Porteño, Club Bolívar, Colo-Colo, entre otros. La final la disputó contra el Club de Regatas Vasco da Gama de Brasil. El partido de ida se desarrolló en la ciudad de Río de Janeiro el 12 de agosto, con la asistencia de Gustavo Méndez (URU) como árbitro central, donde el equipo local derrotó al Barcelona por 2-0. En el partido de vuelta, disputado en la ciudad de Guayaquil en el Estadio Monumental Banco Pichincha el 26 de agosto, con la asistencia de Javier Castrilli (ARG) como árbitro central, el Barcelona no pudo dar vuelta al resultado perdiendo a 1-2 con el equipo brasileño. El Vasco da Gama se convirtió en el campeón de la edición de 1998 de la Copa Libertadores de América, mientras que el subcampeón, Barcelona, perdía su segunda oportunidad de convertirse en el monarca del fútbol continental.

El campeonato ganado en 1997 fue el último título obtenido por el Barcelona. Durante más de una década el club no ha podido ganar el campeonato y a esto se le suma las escasas ocasiones que ha participado en la Copa Libertadores de América.

En los últimos años el equipo amarillo ha perdido protagonismo en el fútbol ecuatoriano, y se le han entablado varias demandas por parte de los ex-jugadores alegando incumplimiento en los pagos y liquidaciones por falta de dinero.²⁷ El control del estadio también ha sido tema de discusión, ya que se ha planteado un embargo de $15,7 millones de dólares. Desde el 2008, con la nueva presidencia de la institución, a cargo del Ec. Eduadro Maruri y como vicepresidente el millonario Luis Noboa surgió una nueva campaña denominada "Barcelona: La Renovación", con lo cual la directiva del equipo invirtió alrededor de 11 millones de dólares sólo en jugadores, también invirtió en el estadio, en los camerinos y en las divisiones menores del club, convirtiéndose en el equipo más caro de la historia del fútbol nacional aunque, a pesar de ello, el Barcelona no ganó ni el campeonato ni uno de los cuatro cupos para la Copa Libertadores 2009. Ese mismo año, a pesar de no conseguir el título, el Barcelona consiguió un aceptable protagonismo, en la liguilla final del Campeonato Ecuatoriano de Fútbol 2008 el club se clasificó quinto, luego de haber empatado la mayoría de los encuentros.

Para la temporada 2009, el equipo contó con la dirección técnica del español Benito Floro, ex técnico y ex director deportivo del Real Madrid, pero con pocos resultados en el campeonato. Uno de los mayores problemas del equipo actual fue la poca efectividad en los juegos en ciudades de la Sierra, donde se juega a más de 2.000 metros sobre el nivel del mar y de donde son la mayoría de sus rivales en el torneo local. Tras la salida de Floro, el equipo quedó prácticamente al borde del descenso con lo cual perdería por primera vez la categoría. Después de los últimos partidos de la temporada 2009, Barcelona logró salvar la categoría con una victoria ante la Liga de Portoviejo.

Para contrarrestar la vulnerabilidad de Barcelona hacia la altura para el año 2010 se tomó la histórica decisión de trasladarse a la ciudad de Quito para aclimatarse a los 2800 msnm, sin embargo los resultados no han sido los que se esperaba salvo un cupo a la sudamericana.

Para la temporada 2010 se empezaron a aplicar ciertas medidas para poder sobrellevar la crisis institucional de Barcelona. Juan Manuel Llop fue ratificado como director técnico, mientras que la plantilla principal cambio de sede de entrenamientos, trasladandose de Guayaquil a Quito, con medianos resultados. Los partidos de local seguían disputandose en Guayaquil. Barcelona en la primera etapa del torneo local 2010 terminó tercero ganándose un cupo a la Copa Sudamericana 2010.²⁸ Lamentablemente terminó la temporada en el cuarto lugar luego de no poder vencer al Deportivo Quito para intentar retornar a la Copa Libertadores de América. Aún la hinchada espera volver a ver a su equipo de amores como el gran equipo de América que fuera en su mejor momento. Barcelona había estado ausente de los torneos internacionales por seis años (la última aparición fue para la Copa Libertadores 2004), en su primer partido de Copa Sudamericana venció al Cesar Vallejo de Perú 2-1.²⁹

El presidente del Barcelona SC es Alfonso "El Pocho" Harb, un político, exdiputado quien fue elegido después de la renuncia del Presidente Juan Carlos Estrada el 23 de diciembre; Estrada fue elegido después de que Eduardo Maruri renunció, este acepto, pero 24 horas después renunció dejándole el puesto a Alfonso Harb Viteri.³⁰ El período de Harb durará desde finales de 2010 hasta las próximas elecciones, dicho por él, en junio del 2011.³¹ Además, agregó que el será el Presidente de la Comisión de Futbol.

A lo largo de la vida de la institución varios personajes han pasado por la presidencia del Barcelona, entre ellos están Isidro Romero, Abdalá Bucaram, Xavier Paulson, Miguel Palacios, Jorge Bejarano, Leonardo Bohrer, Galo Roggiero, Eduardo Maruri y actualmente Alfonso Harb. El primer presidente del equipo fue Carlos García Ríos y su primer presidente honorario fue el español Onofre Castells, actualmente su presidente vitalicio es Jaime Nebot.